1993年开幕的日本职业联赛只有10支球队参加，从1999年开始分成了2等级联赛，到2009年现在为止J1为第1等级联赛、J2相当于第2等级联赛，2个等级联赛各有18支球队构成。J1级联赛按照主客场赛制共进行34场比赛，而J 2级联赛的各队则通过3循环方式来争夺各级联赛的冠军。日本职业联赛从每年3月开始到12月进行。其中J1联赛排名最后的3支球队和排在J2联赛前3名的球队将自动进行升降级调换。

日本职业联赛开幕初期，为了提高足球的人气关注度，首次采用了世界上不常使用的“金球制”（加时赛比赛中，率先进球一方获胜的比赛方式）决胜方式。采用延长期加时赛必须决出胜负的方式会使观众更加兴奋和关注比赛。但是，随着日本国家队不断打进世界杯决赛圈，日本自己的足球文化也在逐渐形成，因此“金球制”决胜法也在2002年被废止。从2003年开始，采用了国际上通用的90分钟比赛平局得1分的方式，球迷则更注重是比赛的过程而不是最后的比分。

目前，日本J联赛的优势在亚洲非常显著。2007年浦和红宝石队作为日本的俱乐部首次捧得亚冠联赛冠军。第二年大阪钢巴再次在亚洲称霸。但是，在亚冠联赛中取得冠军的两支球队却在J联赛中未能夺冠，鹿岛鹿角从2007年开始获得2连霸。在亚冠联赛中夺冠却在联赛中无法卫冕，这说明各个俱乐部的实力都在伯仲之间。

2009年7月现在

年现在